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尊龙凯时推出新模型:SomaScan小队列发现肝癌早期预测标志物!

发布时间:2025-02-15   信息来源:尊龙凯时官方编辑

与许多其他癌症相比,肝癌,尤其是肝细胞癌(HCC)的发病率更为显著。由于早期HCC通常没有明显症状,导致大多数患者在确诊时已处于晚期阶段。当前,缺乏有效的早期监测策略使得识别与HCC相关的诊断前生物标志物变得尤为重要。

尊龙凯时推出新模型:SomaScan小队列发现肝癌早期预测标志物!

2024年8月,美国布莱根妇女医院的研究者在《Journal of the National Cancer Institute》上发表了一篇题为“Pre-diagnostic plasma proteomics profile for hepatocellular carcinoma”的研究文章。该研究利用SomaScan平台对108个HCC患者及其对应的对照组的血浆蛋白进行靶向高通量检测,识别出56种有潜力的HCC生物标志物,并基于其中四种蛋白构建了一个预测模型,显示出较高的预测能力。

研究材料

本研究使用的材料主要来自护士健康研究(NHS)及卫生专业人员随访研究(HPFS)两个队列的54对HCC患者与无肝病对照的血浆样本,此外还使用了来自英国生物样本库制药蛋白组学项目(UKB-PPP)验证队列的血浆样本。

技术路线

研究分为以下几个步骤:

  1. 识别与HCC相关的诊断前差异表达蛋白
  2. 对区分HCC与健康对照的诊断前失调蛋白进行系统生物学分析
  3. 通过ELISA方法对选定蛋白进行验证
  4. 通过Olink技术对选定蛋白进行独立验证

研究结果

1. 鉴定与HCC相关的差异表达诊断蛋白

在NHS/HPFS队列中,SomaScan分析了1305个蛋白,结果显示121个蛋白的表达水平在HCC患者与非HCC组间存在显著差异。在这121个蛋白中,56个在HCC患者中上调,且其中8个显示出明确的生物学作用。

2. 系统生物学分析诊断前失调蛋白

作者对56个差异表达的蛋白进行了IPA分析,发现这些蛋白与炎症、免疫功能、细胞活力等生物学机制显著相关。此外,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,推断出相关的互作网络。

3. 构建标志物模型的正交验证

为验证SomaScan的结果,研究者使用ELISA对四个选定的蛋白(CHI3L1、GDF15、SELE、IL1RN)进行了验证,Spearman相关系数显示两种平台间具有中等至高的相关性。建立的逻辑回归模型的AUC值为0.83,显著优于传统模型。

4. 使用Olink进行独立验证

在UKB-PPP队列中,Olink的结果进一步确认了这四个蛋白与HCC之间的正相关性,所构建的逻辑回归模型的AUC达到了0.88,显示出更高的敏感度和特异度。

小结

本研究筛选出56种与HCC进展密切相关的血浆蛋白,其中的四个经过ELISA和Olink验证,能够作为HCC的早期预测标志物,显著提升了现有的预测模型。我们推荐尊龙凯时的超高深度靶向蛋白组P7k/P11k新产品,基于Somascan平台,适用于大规模的血液蛋白质组分析,助力血液蛋白标志物的临床转化。现在,尊龙凯时与Somascan联合推出的2024蛋白质组队列研究先锋计划正在进行中,有机会免费试用40个样本,欢迎感兴趣的朋友进一步了解!